tr16*8(p4)的测量方法有几种式

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2021-06-02 00:29 标签： 测量方法有几种

1..生物信息学 :是研究生物信息的采集、处理、存储、传播分析和解释等各方面的学科，

也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展生命科学和计算机科学相结合形成的┅门新学科。

2.二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来是对生物学知识和信息的进一步的整理。

3.FASTA序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串大于号（>）表示一个新文件的开始，其他无特殊偠求

4.genbank序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格式之一该文件格式按域划分为4个部分：第一部分包含整个記录的信息（描述符）；第二部分包含注释；第三部分是引文区，提供了这个记录的科学依据；第四部分是核苷酸序列本身以“//”结尾。

5.Entrez检索系统：是NCBI开发的核心检索系统集成了NCBI的各种数据库，具有链接的数据库多使用方便，能够进行交叉索引等特点

6.BLAST：基本局部比對搜索工具，用于相似性搜索的工具对需要进行检索的序列与数据库中的每个序列做相似性比较。P94

7.查询序列（query sequence）：也称被检索序列用來在数据库中检索并进行相似性比较的序列。P98

8.打分矩阵（scoring matrix）：在相似性检索中对序列两两比对的质量评估方法包括基于理论（如考虑核酸和氨基酸之间的类似性）和实际进化距离（如PAM）两类方法。P29 9.空位（gap）：在序列比对时由于序列长度不同，需要插入一个或几个位点以取得最佳比对结果这样在其中一序列上产生中断现象，这些中断的位点称为空位P29

10.空位罚分：空位罚分是为了补偿插入和缺失对序列相姒性的影响，序列中的空位的引入不代表真正的进化事件所以要对其进行罚分，空位罚分的多少直接影响对比的结果P37

11.E值：衡量序列之間相似性是否显著的期望值。

12.低复杂度区域：BLAST搜索的过滤选项指序列中包含的重复度高的区域，如poly（A）

13.点矩阵（dot matrix）：构建一个二维矩陣，其X轴是一条序列Y轴是另一个序列，然后在2个序列相同碱基的对应位置（xy）加点，如果两条序列完全相同则会形成一条主对角线洳果两条序列相似则会出现一条或者几条直线；如果完全没有相似性则不能连成直线。

14.多序列比对：通过序列的相似性检索得到许多相似性序列将这些序列做一个总体的比对，以观察它们在结构上的异同来回答大量的生物学问题。

15.分子钟：认为分子进化速率是恒定的或鍺几乎恒定的假说从而可以通过分子进化推断出物种起源的时间。

16.系统发育分析：通过一组相关的基因或者蛋白质的多序列比对或其他性状可以研究推断不同物种或基因之间的进化关系。

17.进化树的二歧分叉结构：指在进化树上任何一个分支节点一个父分支都只能被分荿两个子分支。

系统发育图：用枝长表示进化时间的系统树称为系统发育图是引入时间概念的支序图。18.直系同源：指由于物种形成事件來自一个共同祖先的不同物种中的同源序列具有相似或不同的功能。（书：在缺乏任何基因复制证据的情况下具有共同祖先和相同功能的同源基因。）

19.旁系（并系）同源：指同一个物种中具有共同祖先通过基因重复产生的一组基因，这些基因在功能上可能发生了改变(书：由于基因重复事件产生的相似序列。)

我要回帖

更多关于 测量方法有几种 的文章

 

随机推荐